Městská památková rezervace starého lázeňského města Třeboň byla vyhlášena již v roce 1949 k ochraně historického jádra s neobyčejnou hodnotou a uceleným souborem historických budov. Významnou památkou náměstí je stará raně barokní radnice s 31 m vysokou vyhlídkovou věží, která je dominantou města. Součástí radničního komplexu je měšťanské divadlo z první poloviny 19. století. Celé náměstí je lemováno měšťanskými domy s renesančními a barokními štíty.
Z historického i kulturního hlediska velmi cenný je dále rozsáhlý renesanční zámek s parkem, který je Dlouhou chodbou propojen s rožmberskou knihovnou a areálem augustiniánského kláštera. U kláštera se nachází dvoulodní kostel sv. Jiljí, významnou památkou je také Schwarzenberská hrobka s kaplí či mariánský sloup. Dochovaly se zde také pozůstatky městského opevnění a hradební brány.